Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms