Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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C4orf47A7E2U8 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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C4orf47A7E2U8 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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C4orf47A7E2U8 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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C4orf47A7E2U8 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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C4orf47A7E2U8 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4orf47A7E2U8 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf47A7E2U8 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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