Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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