Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms