Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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