Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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