Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms