Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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MKRN4PQ13434 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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MKRN4PQ13434 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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MKRN4PQ13434 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
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MKRN4PQ13434 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
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MKRN4PQ13434 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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MKRN4PQ13434 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
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MKRN4PQ13434 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
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