Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXF2Q12947 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXF2Q12947 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXF2Q12947 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXF2Q12947 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXF2Q12947 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXF2Q12947 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXF2Q12947 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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