Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CENPFP49454 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CENPFP49454 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CENPFP49454 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CENPFP49454 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CENPFP49454 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CENPFP49454 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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