Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD13P35453 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD13P35453 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD13P35453 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD13P35453 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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