Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GOPCQ9HD26 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms