Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms