Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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