Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ZNF548Q8NEK5 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ZNF548Q8NEK5 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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ZNF548Q8NEK5 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ZNF548Q8NEK5 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ZNF548Q8NEK5 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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