Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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LAMA3Q16787 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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LAMA3Q16787 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
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LAMA3Q16787 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
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LAMA3Q16787 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
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LAMA3Q16787 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
LAMA3Q16787 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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LAMA3Q16787 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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