Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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