Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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