Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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