Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms