Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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