Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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