Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms