Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms