Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPREP23469 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPREP23469 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPREP23469 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPREP23469 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPREP23469 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPREP23469 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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