Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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