Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms