Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms