Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WASHC2CQ9Y4E1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms