Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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