Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms