Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD1Q9UIS9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD1Q9UIS9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD1Q9UIS9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD1Q9UIS9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD1Q9UIS9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD1Q9UIS9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD1Q9UIS9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms