Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms