Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53CQ9NYF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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