Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC52A1Q9NWF4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A1Q9NWF4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms