Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms