Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms