Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP44Q9H0E7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms