Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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