Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EP400Q96L91 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EP400Q96L91 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EP400Q96L91 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
EP400Q96L91 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
EP400Q96L91 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EP400Q96L91 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EP400Q96L91 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms