Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms