Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms