Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms