Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6Q795 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q6Q795 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q6Q795 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6Q795 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms