Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.387e-18■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.387e-18■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 VPS36-204ENST00000480923 614 ntTSL 316.95■□□□□ 0.32e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 TTLL11-204ENST00000474723 2699 ntTSL 216.13■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 HMBS-212ENST00000542044 1544 ntTSL 516.03■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -02e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-221ENST00000521830 580 ntTSL 414.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 SIRT6-209ENST00000599365 1372 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ABR-227ENST00000574266 597 ntTSL 314.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-219ENST00000521565 547 ntTSL 412.84□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TNRC6C-208ENST00000591851 1642 ntTSL 212.64□□□□□ -0.398e-13■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 SIRT6-208ENST00000597896 827 ntTSL 312.45□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 STN1-204ENST00000472951 783 ntTSL 512.02□□□□□ -0.492e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 DIABLO-202ENST00000342392 1336 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ABR-207ENST00000570525 549 ntTSL 411.85□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 35.4
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