Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms