Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms