Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B3Q16720 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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