Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms