Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD3Q15054 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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